JIF za, npr., 2013. godinu se izračunava tako da se podijeli ukupan broj citata koje su radovi objavljeni u nekom časopisu u prethodne dvije godine (2012. i 2011.) dobili u tekućoj godini (2013.), i taj se broj podijeli s ukupnim brojem radova objavljenih u protekle dvije godine (2012. i 2011.). Pri tome valja imati na umu i često zanemarenu činjenicu da se u brojnik u obzir uzimaju citati dobiveni na sve vrste priloga objavljene u promatranom časopisu, dok se u nazivnik uvrštava samo broj izvornih znanstvenih, preglednih radova i radova s konferencija (article, review i proceedings paper). Ta činjenica posebno pogoduje pojedinim časopisima koji objavljuju ostale vrste radova koji dobivaju citate, ali se ne uračunavaju u nazivnik.

Kako rad koji ste objavili 2013. godine u XY časopisu utječe na njegov IF za 2013. godinu?
Odgovor je NIKAKO! Vaš rad utječe na IF tog XY časopisa tek u naredne 2 godine (2014. i 2015.). Taj utjecaj je pozitivan samo ukoliko u te naredne 2 godine vaš rad bude citiran, a ukoliko nije nijednom citiran, on se samo ubraja u nazivnik kao jedan objavljeni rad (naravno, ukoliko je riječ o izvornom znanstvenom radu, preglednom radu ili radu s konferencije) te na taj način utječe na smanjenje IF-a tog časopisa. Zato pažljivo promislite prije nego IF časopisa upotrijebite kao pokazatelj o "kvaliteti" pojedinih radova objavljenim u tom časopisu. JIF je metrički pokazatelj o časopisima, a ne pojedinačnim radovima u tom časopisu, pa se tako treba i interpretirati.

Za pravilno razumijevanje i interperetaciju faktora odjeka časopisa je vrlo važno biti svjestan i razlike između pojedinih znanstvenih područja te znati da se časopisi iz različitih znanstvenih područja ne mogu i ne smiju uspoređivati putem svojih IF.